本发明公开了一种制造掺混肥的方法，其包括将制取有机酸产生的菌丝体过滤，控制其含水量为30％；然后将菌丝体放置在搅拌机中进行搅拌，并同步向搅拌机中通入氨水，将菌丝体的pH值调节到6-7之间；最后将上述菌丝体与尿素、磷酸一铵、氯化钾按照重量比为13-28∶15-20∶11-15∶10-16的比例充分混合。本发明对制取有机酸剩余的菌丝体在一定条件下进行处理，将处理后的菌丝体与多种无机肥料按照合理的比例进行混合造粒制取掺混肥，减轻了土壤的盐碱化程度，并且菌丝体散入土壤中有利于有益菌群繁殖，平衡土壤中各菌群含量，提高了肥料的利用率；在无机肥中加入有机质与甘露醇，提高了肥料中有机氮的矿化率，培肥地力，提高了作物的抗逆性。