本发明公开了一种海藻生物肥料的制作方法，其包括以下步骤：选取裂壶藻藻渣与功能菌菌种为制备原料，将功能菌菌种在发酵罐内液体培养，直至发酵液菌体达10⁸-10¹⁰cfu/mL，备用；将裂壶藻藻渣接入培养后的功能菌菌种，进行好氧气发酵，得到发酵产物；将发酵产物依次经造粒、烘干、冷却、筛分、包装，得到海藻生物肥料成品。本发明生产的生物有机肥有机质含量及有效活菌数等均超过生物有机肥国家标准(NY/884-2012)，水分、pH值、蛔虫卵死亡率和粪大肠菌群数均符合国家标准(NY/884-2012)。而且本发明投资少、耗能低、见效快，并且减少了污染，创造出社会经济价值，实现了企业内部废弃物的资源化利用。